1.中華民國92年9月29日行政院國家科學委員會臺會綜二字第 0920049038 號函訂定全文7點。
2.中華民國93年11月1日行政院國家科學委員會臺會綜二字第 0930064547 號函修正名稱及全文5點。
  （原名稱：行政院國家科學委員會吳大猷先生紀念獎申請作業要點）
3.中華民國96年5月7日行政院國家科學委員會臺會綜二字第 0960021866 號函修正全文5點；並自即日起實施。              
   中華民國96年5月2日本會第 564 次主管會報修正通過
4.中華民國97年5月8日行政院國家科學委員會臺會綜二字第 0970025995 號函修正第2點。
5.中華民國98年10月28日行政院國家科學委員會臺會綜二字第0980079161號函修正全文5點。
6.中華民國99年10月27日臺會綜二字第0990077677號函修正全文5點。
7.中華民國101年3月29日臺會綜二字第1010019813號函修正第4點。
8.中華民國103年4月17日科技部科部綜字第1030027309號函修正全文5點。
9.中華民國105年1月12日科技部科部綜字第1050003581號函修正第4點。
10.中華民國106年1月26日科技部科部綜字第1060007464號函修正第4點、第5點。
11.中華民國107年5月18日科技部科部綜字第1070033174號函修正。
12.中華民國108年11月28日科技部科部綜字第1080077231A號函修正。
13.中華民國109年12月18日科技部科部綜字第1090075047A號函修正。
14.中華民國111年8月17日國家科學及技術委員會科會綜字第1110052978A號函修正，名稱並修正為「國家科學及技術委員會吳大猷先生紀念獎遴選作業要點」，並溯自中華民國111年7月27日生效。
15.中華民國113年5月16日國家科學及技術委員會科會綜字第1130032253B號函修正第4點，並自即日生效。