1.中華民國94年11月10日行政院國家科學委員會臺會企字第0940070569號函訂定全文 14 點。
2.中華民國103年10月24日科技部科部綜字第1030077206號函修正全文13點。
3.中華民國111年8月17日國家科學及技術委員會科會綜字第1110052978C號函修正，名稱並修正為「國家科學及技術委員會召開機密會議作業要點」，並溯自中華民國111年7月27日生效。