1.中華民國104年6月30日科技部科部科字第1040045394號函訂定全文14點。
2.中華民國108年3月4日科技部科部科字第1080013906號函修正第10點，並自即日生效。
3.中華民國108年12月25日科技部科部科字第1080081815號函修正，並自即日生效。
4.中華民國112年1月3日國家科學及技術委員會科會科字第1120000188號函修正，名稱並修正為「國家科學及技術委員會補助雙邊協議下科技合作交流及活動計畫作業要點」，並自即日生效。
5.中華民國113年12月13日國家科學及技術委員會科會科字第1130085549號函修正第8點，並自即日生效。